根據《道路運輸管理條例》規定，經營道路運輸業務的公司必須申請道路運輸經營許可證。這一證書是運輸公司合法經營的前提，具體辦理流程如下：

1. 向交通管理部門提交申請：提供經營場所證明、車輛證明等相關材料。

2. 通過審查和現場核查：交通管理部門會對公司和車輛進行現場核查，確保符合要求。

3. 領取道路運輸經營許可證：審批通過后，頒發許可證，企業即可合法開展運輸業務。